La DGII se embarca en proyectos dirigidos al fortalecimiento de los procesos tributarios alineados a los objetivos estratégicos de la institución.
 
Cada proyecto está asociado a un objetivo estratégico, fiscalización, Recaudación, Cobranza, de Recursos Humanos asociado a un presupuesto de gastos corrientes porque es desarrollado con recursos internos (gasto de personal, insumos, consultorías, etc.) y la asignación presupuestaria está asociada al gasto general del departamento.
 
Los proyectos de inversión de capital se concentran en las áreas de Tecnología y de infraestructura física que están asociados al objetivo estratégico de apoyo a la gestión tributaria, la ejecución presupuestaria de estos proyectos están disponible en la sección de Ejecución de presupuesto.
 
Existen otros proyectos que han sido definidos como proyectos especiales, debido a su complejidad, como es el caso de la reconstrucción del Data Center, Impresoras Fiscales, etc.